{"id":23511,"date":"2020-02-12T07:48:34","date_gmt":"2020-02-12T07:48:34","guid":{"rendered":"https:\/\/www.christeyns.com\/metagenomics-applied-to-the-food-industry\/"},"modified":"2021-10-25T09:55:28","modified_gmt":"2021-10-25T09:55:28","slug":"metagenomica-aplicada-a-industria-alimentar","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.christeyns.com\/pt-pt\/metagenomica-aplicada-a-industria-alimentar\/","title":{"rendered":"Metagen\u00f3mica aplicada \u00e0 ind\u00fastria alimentar"},"content":{"rendered":"<p>A metagen\u00f3mica \u00e9 uma t\u00e9cnica de sequencia\u00e7\u00e3o de nova gera\u00e7\u00e3o (NGS) apresentada como uma alternativa s\u00f3lida \u00e0 microbiologia tradicional, pois permite identificar todos os microrganismos presentes numa amostra, a n\u00edvel de g\u00e9nero e esp\u00e9cie, amplificando e sequenciando o seu ADN sem a necessidade de serem cultiv\u00e1veis em laborat\u00f3rio [2][3]. Aplicar a metagen\u00f3mica \u00e0 seguran\u00e7a alimentar significa abrir um novo mundo de possibilidades, que at\u00e9 h\u00e1 pouco tempo n\u00e3o eram acess\u00edveis.<\/p>\n<p>O controlo da contamina\u00e7\u00e3o microbiol\u00f3gica \u00e9 de import\u00e2ncia vital para a ind\u00fastria alimentar, a fim de evitar altera\u00e7\u00f5es alimentares ou riscos para a seguran\u00e7a dos consumidores. Os controlos microbiol\u00f3gicos em ambientes alimentares e de trabalho giram geralmente em torno da avalia\u00e7\u00e3o de indicadores microbiol\u00f3gicos, por exemplo, a contagem de microrganismos aer\u00f3bicos totais ou enterobact\u00e9rias, ou a identifica\u00e7\u00e3o da presen\u00e7a de microrganismos patog\u00e9nicos tais como <em>Listeria monocytogenes, Salmonella<\/em> ou <em>Campylobacter<\/em>. Assim, este tipo de controlo concentra-se na dete\u00e7\u00e3o da presen\u00e7a de uma s\u00e9rie de microrganismos previamente selecionados, sem considerar outros microrganismos indesej\u00e1veis que possam estar presentes, quer por falta de conhecimento, quer porque a sua presen\u00e7a \u00e9 considerada improv\u00e1vel.<\/p>\n<p>Esta limita\u00e7\u00e3o ao n\u00edvel de detalhe do estudo de contamina\u00e7\u00e3o microbiol\u00f3gica deve-se principalmente ao facto de o tipo de t\u00e9cnicas de cultivo utilizadas se basearem em meios espec\u00edficos para cada tipo ou grupo de microrganismos. Por conseguinte, n\u00e3o \u00e9 vi\u00e1vel estudar a diversidade microbiana numa amostra utilizando t\u00e9cnicas convencionais. Caracterizar a composi\u00e7\u00e3o da flora microbiana em ambientes alimentares e de produ\u00e7\u00e3o permite conhecer com maior profundidade as intera\u00e7\u00f5es entre os microrganismos e as propriedades alimentares e fornecer solu\u00e7\u00f5es para diferentes necessidades das ind\u00fastrias alimentares, como por exemplo:<\/p>\n<ul>\n<li>Identifica\u00e7\u00e3o dos microrganismos alteradores e sua preval\u00eancia no ambiente de produ\u00e7\u00e3o.<\/li>\n<li>Aplica\u00e7\u00e3o de processos sanit\u00e1rios adaptados a microbiota particular de um ambiente de produ\u00e7\u00e3o.<\/li>\n<li>Identificar agentes causadores de alertas alimentares ou deteriora\u00e7\u00e3o dos alimentos.<\/li>\n<li>Dete\u00e7\u00e3o de altera\u00e7\u00f5es em microbiota regular e identifica\u00e7\u00e3o das causas.<\/li>\n<\/ul>\n<p>A aquisi\u00e7\u00e3o destes conhecimentos \u00e9 agora poss\u00edvel gra\u00e7as \u00e0 metagen\u00f3mica, uma tecnologia inovadora desenvolvida nos \u00faltimos anos como um ramo das ci\u00eancias gen\u00f3micas. A metagen\u00f3mica centra-se no estudo do metagenoma de um nicho espec\u00edfico, ou seja, o ADN total de uma determinada amostra ambiental [1].<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-medium wp-image-23053\" src=\"https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-1-300x275.jpg\" alt=\"\" width=\"300\" height=\"275\" srcset=\"https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-1-300x275.jpg 300w, https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-1-540x494.jpg 540w, https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-1.jpg 567w\" sizes=\"(max-width: 300px) 100vw, 300px\" \/><\/p>\n<p>Este artigo descreve uma das experi\u00eancias levadas a cabo por CHRISYTEINS para melhorar o controlo microbiol\u00f3gico numa ind\u00fastria de peixe. Neste estudo, a metagen\u00f3mica foi aplicada para caracterizar a composi\u00e7\u00e3o da microbiota do produto acabado e as \u00e1reas de trabalho com o objetivo de identificar microrganismos que alteram os alimentos e as vias de transmiss\u00e3o destes microrganismos. As amostras foram recolhidas em diferentes pontos do processo, bem como nos alimentos, ao longo de todo o tempo de armazenamento.<\/p>\n<p>Os resultados obtidos permitiram caracterizar a microbiota predominante em cada ponto do processo de produ\u00e7\u00e3o. A figura 1 mostra a percentagem de abund\u00e2ncia relativa dos 4 principais g\u00e9neros microbianos identificados, em cada um dos pontos de amostragem. Como se mostra, o g\u00e9nero <em>Pseudomonas<\/em> \u00e9 o mais abundante, especialmente nos pontos de filetagem, descasque e fatiagem. A relativa abund\u00e2ncia do g\u00e9nero <em>Stenotrophomonas<\/em> tamb\u00e9m deve ser notada, principalmente no processo de corte.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-medium wp-image-23063\" src=\"https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-2-300x180.jpg\" alt=\"\" width=\"300\" height=\"180\" srcset=\"https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-2-300x180.jpg 300w, https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-2.jpg 425w\" sizes=\"(max-width: 300px) 100vw, 300px\" \/><\/p>\n<h6><strong>Figura 1<\/strong>: A abund\u00e2ncia relativa dos 4 principais g\u00e9neros microbianos durante o processo de produ\u00e7\u00e3o de uma ind\u00fastria pesqueira.<\/h6>\n<p>Al\u00e9m disso, foi realizada a an\u00e1lise metagen\u00f3mica de amostras colhidas nos mesmos pontos do processo de produ\u00e7\u00e3o, mas desta vez ap\u00f3s o processo de limpeza e desinfec\u00e7\u00e3o (Figura 2).<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-medium wp-image-23073\" src=\"https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-3-300x173.jpg\" alt=\"\" width=\"300\" height=\"173\" srcset=\"https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-3-300x173.jpg 300w, https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-3.jpg 425w\" sizes=\"(max-width: 300px) 100vw, 300px\" \/><\/p>\n<h6><strong>Figura 2<\/strong>: Al\u00e9m disso, foi realizada a an\u00e1lise metagen\u00f3mica de amostras colhidas nos mesmos pontos do processo de produ\u00e7\u00e3o, mas desta vez ap\u00f3s o processo de limpeza e desinfec\u00e7\u00e3o (Figura 2).<\/h6>\n<p>Como mostrado na Figura 2, os n\u00edveis do g\u00e9nero <em>Pseudomonas<\/em> s\u00e3o significativamente reduzidos ap\u00f3s o processo de limpeza e desinfe\u00e7\u00e3o. Contudo, a figura tamb\u00e9m mostra que a diminui\u00e7\u00e3o da abund\u00e2ncia relativa de <em>Pseudomonas<\/em> \u00e9 acompanhada por um ligeiro aumento da abund\u00e2ncia relativa de outros g\u00e9neros microbianos tais como <em>Stenotrophomonas, Vagococcus ou Acinetobacter<\/em>.<\/p>\n<p>Finalmente, o produto acabado e a evolu\u00e7\u00e3o da sua microbiota ao longo do tempo foram analisados usando metagen\u00f3mica, at\u00e9 um m\u00e1ximo de 7 dias. Os resultados s\u00e3o mostrados na Figura 3.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-medium wp-image-23083\" src=\"https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-4-300x180.jpg\" alt=\"\" width=\"300\" height=\"180\" srcset=\"https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-4-300x180.jpg 300w, https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2021\/04\/Metagenomics-4.jpg 425w\" sizes=\"(max-width: 300px) 100vw, 300px\" \/><\/p>\n<h6><strong>Figura 3:\u00a0Os principais g\u00e9neros microbianos presentes no produto acabado ao longo do tempo.<\/strong><\/h6>\n<p>Embora a Figura 3 represente a abund\u00e2ncia relativa dos 16 g\u00e9neros microbianos encontrados numa maior percentagem no produto acabado, mostra que apenas 2 g\u00e9neros prevalecem ao longo do tempo: <em>Photobacterium e Pseudomonas.<\/em><\/p>\n<p><em>Photobacterium<\/em> tem uma abund\u00e2ncia relativa de aproximadamente 40%, que se mant\u00e9m mais ou menos est\u00e1vel ao longo do tempo. Por outro lado, <em>Pseudomonas<\/em> tem uma abund\u00e2ncia relativa leve no in\u00edcio, mas aumenta com o tempo, atingindo uma abund\u00e2ncia de aproximadamente 40% no prazo de 3 dias.<\/p>\n<p>Todos estes resultados levam a tirar as seguintes conclus\u00f5es:<\/p>\n<p><em>Pseudomonas<\/em> \u00e9 o principal g\u00e9nero microbiano presente numa ind\u00fastria de transforma\u00e7\u00e3o de peixe ao longo de todo o seu processo de produ\u00e7\u00e3o.<\/p>\n<p>Ao aplicar processos de limpeza e desinfe\u00e7\u00e3o, os n\u00edveis de Pseudomonas s\u00e3o reduzidos durante todo o processo de produ\u00e7\u00e3o, aumentando ligeiramente a abund\u00e2ncia relativa de outros g\u00e9neros microbianos.<\/p>\n<p><em>Photobacterium<\/em> \u00e9 um g\u00e9nero bacteriano frequentemente encontrado em mat\u00e9rias-primas de origem pesqueira, especialmente peixe de aquacultura. Como demonstrado, n\u00e3o existe uma abund\u00e2ncia relativa importante durante o processo de produ\u00e7\u00e3o, provavelmente devido \u00e0 exist\u00eancia de outros g\u00e9neros bacterianos em propor\u00e7\u00f5es mais elevadas. Contudo, desempenha mais uma vez um papel importante no produto acabado, onde a maioria dos g\u00e9neros microbianos s\u00e3o reduzidos a n\u00edveis muito baixos.<\/p>\n<p><em>Pseudomonas<\/em> tem um papel significativo no produto acabado, pois aumenta a sua abund\u00e2ncia relativa ao longo do tempo [4].<\/p>\n<p>Os resultados aqui descritos, juntamente com outros aspetos dos processos de produ\u00e7\u00e3o, limpeza e desinfe\u00e7\u00e3o estudados, permitiram identificar pontos cr\u00edticos de contamina\u00e7\u00e3o cruzada que afetam a vida \u00fatil dos alimentos. Assim, utilizando a metagen\u00f3mica, \u00e9 poss\u00edvel conhecer com maior profundidade a ecologia microbiana dos alimentos e ambientes de produ\u00e7\u00e3o e tomar as medidas adequadas para melhorar a sua qualidade e seguran\u00e7a.<\/p>\n<p>Em CHRISTEYNS oferecemos o servi\u00e7o Metasafe que fornece \u00e0s ind\u00fastrias alimentares e de bebidas as ferramentas necess\u00e1rias para alcan\u00e7ar o grau m\u00e1ximo de controlo sobre as popula\u00e7\u00f5es de microrganismos nos alimentos e instala\u00e7\u00f5es. Desta forma, \u00e9 poss\u00edvel desenvolver produtos mais seguros e de maior qualidade e conseguir um melhor controlo dos alertas microbiol\u00f3gicos. Metasafe \u00e9 um servi\u00e7o revolucion\u00e1rio no sector alimentar e agr\u00edcola, baseado na an\u00e1lise metagen\u00f3mica de alimentos, \u00e1gua e amostras de superf\u00edcie.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>AGRADECIMENTOS<\/p>\n<p><em>Os autores desejam estender a sua aprecia\u00e7\u00e3o ao Instituto Valenciano de Competitividad Empresarial (IVACE) pela atribui\u00e7\u00e3o do projecto de investiga\u00e7\u00e3o &#8220;Evaluaci\u00f3n del impacto de las operaciones de limpieza y desinfecci\u00f3n en la microbiota de las industrias alimentarias&#8221; (IMIDCA\/2016\/19).<\/em><\/p>\n<p>BIBLIOGRAFIA<\/p>\n<p>[1] R Hern\u00e1ndez-Le\u00f3n, I Vel\u00e1zquez-Sep\u00falveda, MC Orozco-Mosqueda, G Santoyo, J Exp Bot.\u00a0<strong>2010<\/strong>, 79, 133-139<em>6<\/em>.<\/p>\n<p>[2] LM Coughlan, PD Cotter, C Hill, A \u00c1lvarez-Ordo\u00f1ez,\u00a0<em>Front. Microbiol<\/em>.\u00a0<strong>2015<\/strong>,\u00a0<em>6<\/em>, 672. doi: 10.3389\/fmicb.2015.00672<\/p>\n<p>[3] CJ Doyle, PW O\u2019Toole, PD Cotter.\u00a0<em>Environ. Microbiol<\/em>,\u00a0<strong>2017<\/strong>,\u00a0<em>19<\/em>, 11, 4382-4391.<\/p>\n<p>[4] T Moretro, B Moen, E Heir, AA Hansen, S Lansrud.\u00a0<em>Int J. Food Microbiol<\/em>,\u00a0<strong>2016<\/strong>,\u00a0<em>237<\/em>, 98-108.<\/p>\n<p><strong>Sanz-Puig M.<\/strong><strong><sup>1<\/sup><\/strong><strong>, Lorenzo F.<\/strong><strong><sup>1<\/sup><\/strong><strong>, Bert\u00f3 R.<\/strong><strong><sup>1<\/sup><\/strong><strong>,\u00a0Orihuel E<\/strong><strong><sup>1<\/sup><\/strong><strong>.<\/strong><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>A metagen\u00f3mica \u00e9 uma t\u00e9cnica de sequencia\u00e7\u00e3o de nova gera\u00e7\u00e3o (NGS) apresentada como uma alternativa s\u00f3lida \u00e0 microbiologia tradicional, pois permite identificar todos os microrganismos presentes numa amostra, a n\u00edvel de g\u00e9nero e esp\u00e9cie, amplificando e sequenciando o seu ADN sem a necessidade de serem cultiv\u00e1veis em laborat\u00f3rio [2][3]. 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