{"id":19772,"date":"2016-10-28T11:02:01","date_gmt":"2016-10-28T09:02:01","guid":{"rendered":"http:\/\/www.betelgeux.es\/blog\/?p=492"},"modified":"2023-08-23T10:13:12","modified_gmt":"2023-08-23T10:13:12","slug":"metasafe-un-nivel-superior-de-conocimiento-sobre-la-microbiota-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.christeyns.com\/es-es\/metasafe-un-nivel-superior-de-conocimiento-sobre-la-microbiota-2\/","title":{"rendered":"Metasafe, un nivel superior de conocimiento sobre la microbiota"},"content":{"rendered":"<p><strong>Las nuevas t\u00e9cnicas de an\u00e1lisis metagen\u00f3mico permiten caracterizar de forma completa las comunidades microbianas presentes en alimentos y entornos de trabajo.\u00a0<\/strong><!--more--><\/p>\n<p style=\"text-align: justify\">Nuestro mundo est\u00e1 dominado por los microbios. Aunque generalmente no podemos verlos, los microbios son esenciales para todos los aspectos de la vida en el planeta. Su abundancia y diversidad en el entorno es enorme: un litro de agua marina o un kilogramo de tierra pueden contener mil millones de microorganismos y hasta 100.000 especies diferentes. Esta abundancia y diversidad se extiende a los alimentos, que albergan numerosas especies de microorganismos y a las superficies en contacto con los mismos. Desafortunadamente, se estima que el 99 % de los microorganismos existentes no son cultivables en condiciones de laboratorio. Esto limita enormemente nuestra capacidad para conocer de forma detallada la flora microbiana presente en alimentos y entornos de trabajo, y para identificar los microorganismos que pueden causar problemas de calidad o seguridad en los alimentos.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\">Uno de los acontecimientos m\u00e1s notables en el campo de la ecolog\u00eda microbiana en los \u00faltimos a\u00f1os es el desarrollo de la metagen\u00f3mica, favorecido por los avances producidos en t\u00e9cnicas de secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica masiva y en las t\u00e9cnicas inform\u00e1ticas para el procesado de datos. La metagen\u00f3mica se define como el an\u00e1lisis directo del material gen\u00e9tico contenido en una muestra. Esta t\u00e9cnica no precisa el cultivo de microorganismos y permite conocer la identidad de los microorganismos presentes en la muestra a nivel de g\u00e9nero y, en muchas ocasiones, de especie.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\">El estudio de la diversidad bacteriana en muestras de alimentos y superficies se basa en la secuenciaci\u00f3n del fragmento de ADN bacteriano que codifica la formaci\u00f3n del RNA ribosomal 16S. El gen 16S rRNA est\u00e1 presente en todas las bacterias y presenta regiones fuertemente conservadas y comunes a todas ellas, lo que permite el dise\u00f1o de reactivos espec\u00edficos para la extracci\u00f3n y amplificaci\u00f3n de estos fragmentos. Asimismo, el gen 16S rRNA contiene regiones variables, espec\u00edficas de g\u00e9neros y especies bacterianos, lo que permite su identificaci\u00f3n.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\"><span style=\"color: #ffffff\">_<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter wp-image-493 size-full\" src=\"https:\/\/www.christeyns.com\/wp-content\/uploads\/2016\/10\/grafico-metasafe.jpg\" alt=\"grafico-metasafe\" width=\"257\" height=\"320\" \/><\/p>\n<p style=\"text-align: center\">Figura 1. Representaci\u00f3n esquem\u00e1tica de los procesos implicados en el an\u00e1lisis metagen\u00f3mico de muestras ambientales.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\"><span style=\"color: #ffffff\">_<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify\">La utilidad y relevancia de esta t\u00e9cnica es enorme para afrontar problemas relacionados con la presencia de microorganismos no deseados en los alimentos e instalaciones de producci\u00f3n: alteraci\u00f3n de los alimentos, intoxicaciones de origen alimentario, contaminaci\u00f3n persistente, etc. Sin embargo, el estudio metagen\u00f3mico no es trivial, y requiere un adecuado ajuste de los protocolos de recogida de muestras y extracci\u00f3n del material gen\u00e9tico, as\u00ed como un complejo an\u00e1lisis bioinform\u00e1tico de los resultados obtenidos y su posterior interpretaci\u00f3n. Por estas razones, es necesario un profundo conocimiento del proceso de secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica, as\u00ed como de la ecolog\u00eda microbiana en la industria alimentaria para conseguir un estudio exitoso. El <strong><a href=\"http:\/\/www.betelgeux.es\/images\/files\/Catalogos\/Servico_Metasafe_metagenomica.pdf\">servicio MetaSafe<\/a><\/strong>, ofrecido por las empresas Betelgeux e Imegen agro, es una herramienta pionera en la industria alimentaria, y gracias a la especializaci\u00f3n de los equipos t\u00e9cnicos y al esfuerzo realizado por ambas empresas, ya se encuentra disponible en el mercado.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\">Las aplicaciones de esta tecnolog\u00eda para la mejora de los procesos de producci\u00f3n e higiene de alimentos son numerosas, todas ellas basadas en la adquisici\u00f3n de un nivel de conocimiento de la comunidad microbiana superior al que es posible obtener mediante t\u00e9cnicas convencionales. Por ejemplo, el estudio metagen\u00f3mico peri\u00f3dico de alimentos e instalaciones permite establecer una ecolog\u00eda microbiana t\u00edpica, representativa de los procesos de producci\u00f3n e higiene normales. De esta forma, es posible identificar alteraciones en la comunidad microbiana relacionadas con alteraciones o degradaci\u00f3n de los alimentos o con cambios en los procesos de producci\u00f3n e higiene. As\u00ed, es posible adquirir mayor conocimiento sobre la relaci\u00f3n entre las propiedades de los alimentos, su microbiota y la microbiota del entorno que los rodea, lo que permite generar procesos productivos m\u00e1s robustos y fiables.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\">A continuaci\u00f3n se muestran de forma resumida los resultados obtenidos en un ensayo del servicio MetaSafe, en el que se tomaron muestras de distintas superficies de trabajo en dos industrias pesqueras diferentes (ver Tabla 1).<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\"><span style=\"color: #ffffff\">_<\/span><\/p>\n<table>\n<tbody>\n<tr>\n<td width=\"246\"><strong>\u00a0<\/strong><\/td>\n<td width=\"123\"><strong>Industria 1<\/strong><\/td>\n<td width=\"104\"><strong>Industria 2<\/strong><\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td width=\"246\"><strong>N\u00ba especies promedio por muestra<\/strong><\/td>\n<td width=\"123\">462<\/td>\n<td width=\"104\"><em>757<\/em><\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td width=\"246\"><strong>Total especies identificadas<\/strong><\/td>\n<td width=\"123\">1289<\/td>\n<td width=\"104\"><em>1455<\/em><\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td width=\"246\"><strong>Total g\u00e9neros identificados<\/strong><\/td>\n<td width=\"123\">563<\/td>\n<td width=\"104\"><em>648<\/em><\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td width=\"246\"><strong>Total familias identificadas<\/strong><\/td>\n<td width=\"123\"><em>214<\/em><\/td>\n<td width=\"104\"><em>224<\/em><\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td width=\"246\"><strong>G\u00e9neros predominantes<\/strong><\/td>\n<td width=\"123\"><em>Vibrio<\/em><em>Cobetia<\/em><\/p>\n<p><em>Pseudomonas<\/em><\/p>\n<p><em>Flavobacterium<\/em><\/p>\n<p><em>Novosphingobium<\/em><\/td>\n<td width=\"104\"><em>Pseudomonas<\/em><em>Acinetobacter<\/em><\/p>\n<p><em>Delftia<\/em><\/p>\n<p><em>Photobacterium<\/em><\/p>\n<p><em>Colwellia<\/em><\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n<p style=\"text-align: center\">Tabla 1. Resumen de caracter\u00edsticas de la ecolog\u00eda microbiana encontrada en muestras tomadas en dos industrias pesqueras mediante an\u00e1lisis metagen\u00f3mico (servicio MetaSafe).<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\"><span style=\"color: #ffffff\">_<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify\">Los resultados obtenidos permiten evaluar el amplio rango de informaci\u00f3n que proporciona el an\u00e1lisis metagen\u00f3mico frente al control microbiol\u00f3gico convencional. Las muestras analizadas muestran una compleja composici\u00f3n microbiana, cuyas caracter\u00edsticas son espec\u00edficas de la industria analizada. As\u00ed, en una de las industrias pesqueras estudiadas se identificaron un total de 1289 especies bacterianas, pertenecientes a 563 g\u00e9neros distintos, siendo <em>Vibrio <\/em>y <em>Cobetia<\/em> los predominantes. En la segunda industria estudiada, se identificaron un total de 1455 especies, pertenecientes a 648 g\u00e9neros bacterianos, entre los que <em>Pseudomonas <\/em>y <em>Acinetobacter<\/em> fueron los predominantes.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\">Aparte de las diferencias encontradas entre las comunidades microbianas en ambas industrias, se encontraron tambi\u00e9n similitudes y diferencias entre grupos de muestras de la misma industria. Por ejemplo, las muestras de suelos presentaron una composici\u00f3n microbiana sustancialmente diferente a las muestras recogidas en cintas y superficies de acero inoxidable, que mostraron una composici\u00f3n m\u00e1s homog\u00e9nea entre las mismas.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\">Finalmente, el estudio realizado permiti\u00f3 evaluar el impacto de las actividades de limpieza y desinfecci\u00f3n sobre la flora microbiana de las superficies. As\u00ed, se encontr\u00f3 que determinados procedimientos y productos utilizados afectan de forma desigual a las diferentes bacterias encontradas, de manera que es necesario ajustar estos procesos de higiene a la ecolog\u00eda microbiana particular de cada caso.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\">La informaci\u00f3n obtenida en el estudio descrito no se puede obtener de forma viable mediante m\u00e9todos convencionales, basados en el cultivo o en la identificaci\u00f3n individual de los microorganismos en la muestra. La potencia del an\u00e1lisis metagen\u00f3mico para el estudio de comunidades microbiol\u00f3gicas complejas supone una herramienta potencialmente revolucionaria para el sector alimentario. La aplicaci\u00f3n de estas t\u00e9cnicas, acompa\u00f1ada de un adecuado dise\u00f1o de los estudios e interpretaci\u00f3n de los resultados, permite conocer en detalle las interacciones de las comunidades microbianas de alimentos y su entorno con distintos factores productivos y de higiene. Esto permite, por un lado, ajustar estos procesos productivos y de higiene a las caracter\u00edsticas particulares de cada industria alimentaria, teniendo en cuenta la idoneidad en el uso de los distintos principios activos biocidas permitidos, as\u00ed como la necesidad de ajustar la rotaci\u00f3n de estos principios activos sobre la base de estos resultados. Por otro lado, mediante este conocimiento es posible dise\u00f1ar nuevos procesos que mejoren las propiedades, calidad y seguridad de los alimentos producidos.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify\">Las crecientes demandas sociales, normativas y t\u00e9cnicas a las que est\u00e1 sometida la industria alimentaria requieren una evoluci\u00f3n constante y alto grado de profesionalizaci\u00f3n de todos sus procesos, incluido el mantenimiento de la higiene. Por esta raz\u00f3n, es necesario incorporar los avances que se producen en distintas disciplinas cient\u00edficas y tecnol\u00f3gicas, como es el caso del an\u00e1lisis metagen\u00f3mico, con el fin de mejorar los procesos productivos y la competitividad de las industrias. Consideramos que esta nueva herramienta de control microbiol\u00f3gico nos va a permitir ajustar y optimizar los procesos de limpieza y desinfecci\u00f3n industriales, pudiendo controlar de manera exhaustiva la eficacia y eficiencia de los protocolos establecidos. Tambi\u00e9n podremos as\u00ed detectar aquellas zonas o puntos de las plantas de procesado en las que por resultados incorrectos deberemos actuar de manera diferente, por ejemplo identificando con t\u00e9cnicas de control espec\u00edficas <a href=\"http:\/\/biofilmtest.com\/tbf-300s\/\">(TBF\u00ae300S)<\/a>, la posible presencia de biofilms.<\/p>\n<hr \/>\n<p style=\"text-align: justify\">Art\u00edculo publicado en la revista <a href=\"https:\/\/www.interempresas.net\/Alimentaria\/Articulos\/161465-Metasafe-un-nivel-superior-de-conocimiento-sobre-la-microbiota.html\">INTEREMPRESAS <\/a>n\u00ba 1263\u00a0en octubre de 2016.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Las nuevas t\u00e9cnicas de an\u00e1lisis metagen\u00f3mico permiten caracterizar de forma completa las comunidades microbianas presentes en alimentos y entornos de 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