{"id":1531,"date":"2019-06-21T10:37:57","date_gmt":"2019-06-21T08:37:57","guid":{"rendered":"http:\/\/www.betelgeux.es\/blog\/?p=1531"},"modified":"2023-08-23T09:32:20","modified_gmt":"2023-08-23T09:32:20","slug":"metagenomica-la-microbiologia-del-futuro-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.christeyns.com\/es-es\/metagenomica-la-microbiologia-del-futuro-2\/","title":{"rendered":"Metagen\u00f3mica, la microbiolog\u00eda del futuro"},"content":{"rendered":"

En los \u00faltimos a\u00f1os la metagen\u00f3mica ha revolucionado la microbiolog\u00eda tradicional. La principal ventaja que nos ofrece el an\u00e1lisis metagen\u00f3mico 16S es que nos permite identificar, en su totalidad, los microorganismos presentes en cualquier muestra ambiental. Los resultados del an\u00e1lisis metagen\u00f3mico permiten obtener una gran cantidad de datos a partir de una sola muestra, identificando tambi\u00e9n aquellos microorganismos que no pueden ser aislados por cultivo en placa, como los viables no cultivables. Adem\u00e1s, se obtiene una identificaci\u00f3n precisa de los microorganismos presentes en cada muestra, a todos los niveles taxon\u00f3micos: Filo, Clase, Orden, Familia, G\u00e9nero y Especie, acompa\u00f1ados en cada caso de su abundancia relativa.
\nEste tipo de an\u00e1lisis abre la puerta a un gran abanico de posibilidades que incluyen la identificaci\u00f3n de microorganismos causantes de alteraciones en los alimentos, el estudio de las relaciones entre la presencia de determinados microorganismos y la vida \u00fatil de los alimentos, la caracterizaci\u00f3n microbiana de procesos productivos o el estudio del impacto de los procesos habituales de higiene en la ecolog\u00eda microbiana de las plantas de producci\u00f3n de alimentos.<\/p>\n

La caracterizaci\u00f3n de la ecolog\u00eda microbiana de un proceso productivo en una industria alimentaria nos aporta much\u00edsima informaci\u00f3n que puede ser muy \u00fatil, ya que nos permite conocer en profundidad todos los microorganismos que se encuentran en cada uno de los puntos de procesado del producto, para as\u00ed poder detectar la presencia de microorganismos pat\u00f3genos y\/o alterantes, adem\u00e1s de microorganismos con capacidad para formar biofilms o formas de resistencia, as\u00ed como asociaciones entre microorganismos.
\nCon este tipo de an\u00e1lisis podemos, adem\u00e1s, comparar la ecolog\u00eda microbiana de diferentes industrias de producci\u00f3n de alimentos. En este sentido, el an\u00e1lisis metagen\u00f3mico 16S nos ha permitido caracterizar microbiol\u00f3gicamente diferentes procesos productivos en distintas industrias alimentarias, concretamente una industria pesquera y una industria de vegetales congelados.
\nEn el caso de la industria pesquera, los resultados de metagen\u00f3mica han permitido identificar un gran n\u00famero de microorganismos diferentes, hasta 1.808 especies bacterianas, tal y como se observa en la Tabla 1.<\/p>\n

Tabla 1. N\u00famero de microorganismos identificados en cada nivel taxon\u00f3mico en industria pesquera.<\/span><\/p>\n

\"Tabla<\/p>\n

Estos datos se corresponden, concretamente, con los procesos productivos de salm\u00f3n y at\u00fan. En las Figuras 1 y 2 se especifican con detalle los 10 g\u00e9neros bacterianos mayoritarios en cada uno de los puntos muestreados, as\u00ed como su abundancia relativa.<\/p>\n

\"Figura<\/a><\/p>\n

Figura 1. Principales g\u00e9neros microbianos presentes en el proceso de producci\u00f3n de at\u00fan.<\/span><\/p>\n

Tal y como se puede observar en las Figuras 1 y 2, uno de los g\u00e9neros bacterianos mayoritarios a lo largo de todo el proceso de elaboraci\u00f3n tanto del at\u00fan como del salm\u00f3n es Pseudomonas <\/em>spp. Las bacterias pertenecientes a este g\u00e9nero son Gram-negativas, ubicuas, que se establecen con facilidad en ambientes h\u00famedos y pueden ser persistentes en ambientes de procesado de alimentos (Palleroni, 2015). Su persistencia se ve favorecida por sus bajos requerimientos de crecimiento, as\u00ed como por su capacidad de crecer a bajas temperaturas o de formar biofilms, lo que les permite protegerse de los agentes biocidas, aumentando su tolerancia a los mismos (Moretro y Langsrud, 2017).<\/p>\n

Asimismo, cabe destacar la presencia de otros g\u00e9neros bacterianos como Stenotrophomonas <\/em>spp., Vagococcus<\/em> spp. o Enterobacter <\/em>spp. El g\u00e9nero Stenotrophomonas <\/em>spp. est\u00e1 formado por bacterias Gram-negativas, que se pueden aislar de todo tipo de ambientes. Poseen pili o fimbrias, que est\u00e1n implicadas tanto en su adhesi\u00f3n a las superficies como en la formaci\u00f3n de biofilms. Por su parte, el g\u00e9nero Vagococcus<\/em> spp. est\u00e1 formado por bacterias Gram-positivas, anaerobias facultativas, que poseen flagelos peritricos y se a\u00edslan normalmente del agua o de peces salm\u00f3nidos. Finalmente, las bacterias del g\u00e9nero Enterobacter<\/em> spp. son Gram-negativas, anaerobias facultativas y presentan flagelos peritricos. Se pueden encontrar en gran variedad de ambientes como agua, suelo o aguas residuales.<\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

Figura 2.Principales g\u00e9neros microbianos presentes en el proceso de producci\u00f3n de salm\u00f3n.<\/span><\/p>\n

Respecto a los resultados metagen\u00f3micos obtenidos en la industria de vegetales congelados, tal y como se puede apreciar en la Tabla 2, se han identificado un total de 2.367 especies bacterianas. En la Figura 3 se detallan los 10 g\u00e9neros bacterianos con una mayor abundancia relativa en cada uno de los puntos muestreados.<\/p>\n

Tabla 2. N\u00famero de microorganismos identificados en cada nivel taxon\u00f3mico en la industria de vegetales congelados.<\/span><\/p>\n

\"Tabla<\/p>\n

En el proceso productivo de vegetales congelados cabe destacar la presencia, en todos los puntos muestreados, del g\u00e9nero bacteriano Calothrix <\/em>spp. Las bacterias que conforman este g\u00e9nero son cianobacterias, que pueden ser aisladas de gran variedad de ambientes terrestres y de agua dulce. Adem\u00e1s, presentan la capacidad de formar biofilms, en los cuales se pueden encontrar, junto a otras cianobacterias, en ambientes muy diversos tales como el suelo, plantas, cuevas o glaciares (Rippka et al., 2015; Bharti et al., 2017).<\/p>\n

Adem\u00e1s, los g\u00e9neros bacterianos Weissella <\/em>spp., Prevotella<\/em> spp. y Rickettsia <\/em>spp. <\/em>presentan valores destacados de abundancia relativa a lo largo de todo el proceso productivo. Concretamente, Weissella <\/em>spp. es un g\u00e9nero de bacterias Gram-positivas, anaerobias facultativas, con un metabolismo fermentativo obligado, que pueden aislarse de una amplia variedad de ambientes, como por ejemplo, plantas y vegetales, piel, leche o heces de animales, as\u00ed como diferentes productos fermentados. Rickettsia <\/em>spp. es un g\u00e9nero constituido por bacterias Gram-negativas, que suelen tener como v\u00eda de transmisi\u00f3n los animales artr\u00f3podos. Por \u00faltimo, el g\u00e9nero bacteriano Prevotella<\/em> spp. est\u00e1 formado por bacterias Gram-negativas, anaer\u00f3bicas y con capacidad de formar biofilms.<\/p>\n

\"Figura<\/a><\/p>\n

Figura 3. Principales g\u00e9neros microbianos presentes en el proceso de producci\u00f3n de vegetales congelados.<\/span><\/p>\n

Finalmente, el estudio pormenorizado de los resultados obtenidos por an\u00e1lisis metagen\u00f3mico nos permite concluir que existen g\u00e9neros bacterianos presentes en todos los puntos de muestreo a lo largo de los procesos productivos estudiados. Estos g\u00e9neros, Pseudomonas<\/em> spp. en el caso de la industria pesquera y Calothrix<\/em> spp. en el caso de la industria de vegetales congelados, presentan a su vez capacidad de formar biofilms. Por lo tanto, estos g\u00e9neros bacterianos podr\u00edan estar de forma persistente a lo largo de todo el proceso productivo en forma de biofilms y favorecer, adem\u00e1s, la adhesi\u00f3n a este biofilm del resto de g\u00e9neros bacterianos identificados o incluso de bacterias pat\u00f3genas y\/o alterantes procedentes de la materia prima o del ambiente, dando lugar a biofilms multiespecie.<\/p>\n

BETELGEUX-CHRISTEYNS cuenta con una amplia gama de productos para la detecci\u00f3n y eliminaci\u00f3n de todo tipo de biofilms, entre los que se encuentran el TBF300<\/a> y TBF300S<\/a>, dos productos que fueron desarrollados con la colaboraci\u00f3n de la Universidad Complutense de Madrid.<\/p>\n

Referencias<\/strong><\/p>\n

Bharti, A., Velmourougane, K., Prasanna, R. (2017). Phototrophic biofilms: diversity, ecology and applications. Journal of applied Phycology. DOI 10.1007\/s10811-017-1172-9.<\/p>\n

Moretro, T., Langsrud, S. (2017). Residential Bacteria on Surfaces in the Food Industry and Their Implications for Food Safety and Quality. Comprehensive Reviews in Food Science and Food Safety, 16.<\/p>\n

Palleroni, N.J. (2015). Pseudomonas<\/em>. Bergey\u2019s Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. DOI: 10.1002\/9781118960608.gbm01210.<\/p>\n

Rippka, R., Castenholz, R.W., Herdman, M. (2015). Form-Calothrix<\/em>. Bergey\u2019s Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. DOI: 10.1002\/9781118960608.gbm00462.<\/p>\n

 <\/p>\n

*Este estudio cient\u00edfico ha sido presentado esta misma semana en el V Congreso Internacional de Calidad y Seguridad alimentaria, organizado por ACOFESAL celebrado en Barcelona del 19 al 21 de junio de 2019.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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